據(jù)中央廣播電視總臺(tái)中國(guó)之聲《新聞超鏈接》報(bào)道，近日，中國(guó)科學(xué)家以我國(guó)特有家雞品系“胡須雞”為材料，在國(guó)際上率先繪制完成家雞的全基因組完整圖譜，實(shí)現(xiàn)了基因組圖譜繪制技術(shù)在經(jīng)濟(jì)動(dòng)物中的首次應(yīng)用。

全基因組圖譜部分內(nèi)容（圖片來(lái)源：西南大學(xué)）

(資料圖片僅供參考)

繪制家雞的全基因組完整圖譜有多難？為什么要給雞測(cè)基因組？未來(lái)，我們可能吃上由基因研究培育出來(lái)的雞嗎？

用中國(guó)特有的雞做研究

2004年，國(guó)際團(tuán)隊(duì)已經(jīng)合作繪制出了雞基因組圖譜草圖。隨后十幾年里，雞的基因組信息雖不斷完善，但受限于測(cè)序技術(shù)，基因組圖譜始終不夠完整。這一次，西南大學(xué)生命科學(xué)學(xué)院教育部重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室徐洛浩教授課題組，鑒定了原先缺失的6條染色體，終于組裝出了完整的家雞基因組圖譜。該研究成果已發(fā)表在《美國(guó)科學(xué)院院刊》，圖譜信息也開(kāi)放共享，提供給所有科學(xué)家，希望可以促進(jìn)交流合作，共同創(chuàng)造有價(jià)值的研究。

研究團(tuán)隊(duì)此次使用的是“長(zhǎng)讀長(zhǎng)”測(cè)序技術(shù)，這種新的測(cè)序技術(shù)，恰好能彌補(bǔ)之前的短板。雞總共有39條染色體，大小各異。之前缺失的6條染色體都特別小，是點(diǎn)狀染色體，使用之前的“短讀長(zhǎng)”測(cè)序技術(shù)難以覆蓋。之前的測(cè)序技術(shù)需要將DNA打斷成很小的片段，測(cè)序后再重新拼接成全基因組；此次采用的“長(zhǎng)讀長(zhǎng)”測(cè)序技術(shù)則盡量不打斷DNA，減少了后續(xù)的拼接過(guò)程。利用新的測(cè)序技術(shù)，研究團(tuán)隊(duì)揭開(kāi)了這6條染色體的神秘面紗——這些染色體雖小，基因數(shù)量卻不少，其中不少還是具有保守功能的基因。

惠陽(yáng)胡須雞，頜下有張開(kāi)的胡須狀髯羽

此次研究的胡須雞，是中國(guó)特有的家雞品系。胡須雞是廣東的地方品種，肉質(zhì)鮮美，在當(dāng)?shù)仡H受歡迎。徐洛浩教授表示，選擇胡須雞是一個(gè)巧合，但也有出于學(xué)術(shù)研究的考慮——雞的馴化很可能是在中國(guó)發(fā)生的，因此測(cè)定家雞的全基因組信息時(shí)，最好是以中國(guó)的品種作為代表。

育種進(jìn)入分子時(shí)代

未來(lái)的家雞育種，或許就用得上此次繪制的全基因組完整圖譜。

育種在過(guò)去主要是通過(guò)雜交實(shí)現(xiàn)，但現(xiàn)在已經(jīng)進(jìn)入分子時(shí)代，基因組信息可以提供不同的育種思路。例如，可以將全基因組中的具體位點(diǎn)與具體的性狀聯(lián)系起來(lái)，在未來(lái)育種的時(shí)候，通過(guò)基因測(cè)序，精準(zhǔn)且全面地選擇出包含這些優(yōu)良性狀的個(gè)體，極大加快育種選擇進(jìn)程。不過(guò)，要實(shí)現(xiàn)從基因組圖譜到育種的產(chǎn)學(xué)結(jié)合，還需要學(xué)界與業(yè)界進(jìn)行更多合作。

家雞養(yǎng)殖基地（圖片來(lái)源：西南大學(xué)）

值得一提的是，此次公布的家雞全基因組完整圖譜，也是繼去年人類基因組完成圖公布以來(lái)，首個(gè)發(fā)表的脊椎動(dòng)物基因組完成圖。

目前，全球科學(xué)家正在為很多個(gè)物種繪制全基因組完整圖譜，這些物種包括水稻、玉米、牛羊等重要經(jīng)濟(jì)物種。為什么是雞首先被測(cè)出來(lái)，徐洛浩認(rèn)為主要有兩個(gè)原因：一方面，雞本身的基因組相對(duì)簡(jiǎn)單，測(cè)序比較容易成功；另一方面，相關(guān)研究團(tuán)隊(duì)的研究起步較早，全基因組圖譜繪制工作甚至略早于人類基因組圖譜。在充足的準(zhǔn)備之下，突破也來(lái)得更快。隨著高通量測(cè)序的發(fā)展、計(jì)算存儲(chǔ)能力的提升，未來(lái)將會(huì)有更多基因組完整圖譜被繪制出來(lái)，更多難題將被攻克。

徐洛浩表示，未來(lái)研究團(tuán)隊(duì)希望能夠收集更多的種質(zhì)資源，并從中挖掘育種素材。除家雞育種外，他們也將目光投向羅非魚(yú)等物種身上。在分子時(shí)代，基因組信息定會(huì)給育種帶來(lái)不一樣的突破。

監(jiān)制：白中華

記者：鶴佳

編輯：馬露絲 楊揚(yáng) 彭毓姬

標(biāo)簽： 西南大學(xué)